Skylog kann von der Skylog-Webseite aktualisiert werden. Das Update kann runtergeladen und anstelle der älteren Version installiert werden. Die Datenbank sollte nicht im Installationsverzeichnis von Skylog liegen, sonst können die Daten verloren gehen.
Mit der Umstellung auf Skylog 2.2.0 ändert sich das Datenbank-Format. Die Migration erfolgt durch Exportieren der Flugbücher und Ausbildungsnachweise und Importieren in die neue Version.
Nach der Installation müssen die Einstellungen neu eingegeben werden. Ab Skylog 2.0 können die Einstellungen auch exportiert und reimportiert werden.
Eine automatische Aktualisierung ist nicht mehr möglich.